科学研究

我们的成果

 
 
 

基因组测序部

       基因组测序部主要从事模式生物,病原生物、微生物和植物等基因组和转录组测序研究工作。先后承担和参与了国家多项重大基因组研究项目,包括人类和其它哺乳动物基因组(黑猩猩和蝙蝠等);肿瘤和遗传性疾病基因组(儿童白血病,肺癌和家族性肺静脉栓塞等);寄生虫基因组和转录组(日本血吸虫,细粒棘球绦虫和疟原虫等);病原微生物全基因组(结核分枝杆菌、钩端螺旋体和SARS冠状病毒等);微生物宏基因组(人体、海洋和特殊环境等);昆虫基因组(蜜蜂、家蚕和叶蝉);真菌基因组(草菇,灵芝,冬虫夏草,青霉菌等),植物基因组(水稻和棉花等)测序项目。相关研究成果在《Nature》,《Science》,《Nature Genetics》,《PNAS》和《Genome Research》等国际一流学术期刊上发表。 在过去几年里,南方中心测序部充分发挥了高通量测序和分析平台的作用,已为国内外上百家大学,科研院所和企业提供了数百项科研合作机会和服务。


遗传学研究部

       在国内率先建立了全基因组微卫星标记的扫描分型技术体系和全基因组关联研究的芯片技术检测体系,从事基因组多样性研究、中国人群的遗传结构研究以及重要疾病的相关基因定位、克隆。成功地定位了若干单基因遗传性疾病的相关基因于人类染色体区域,并找到疾病的突变基因;定位了鼻咽癌易感基因;发现肝癌组织杂合性丢失高发区域;定位了若干与高血压、糖尿病等相关的基因区域。构建了中国人基因组SNP参考系统目录,并与灵长类基因组序列进行比较基因组学研究,从进化角度理解基因组结构和功能特征。相关研究工作在Science、Nature Genetics、PNAS等杂志发表。近年来,利用遗传多态性研究技术平台,完成了国际HapMap计划的中国协作组工作,构建了21号染色体单倍型图谱;系统地开展了“中华民族单核苷酸多态性的开发应用”研究工作,建成中国人基因组SNP及其单倍型数据库;利用所建立的高通量基因芯片分析平台,开展了多个重要复杂性状疾病的全基因组关联研究(GWAS),包括甲状腺疾病(Graves’disease)、精神疾病、高血压、银屑病、系统性红斑狼疮、白癜风和麻风病等,多篇研究论文发表在《Nature Genetics》(《自然遗传学》)和《New England Journal of Medicine》(《新英格兰医学杂志》)上。


功能基因组学研究部

       基于我国有特色的或有研究基础的生命科学研究方向,借助大规模DNA测序、细胞转染、基因芯片等技术平台并结合分子细胞生物学、遗传学等技术,组织相关科研单位开展了如下工作: (1)通过日本血吸虫系统生物学研究,深入研究了血吸虫寄生和致病分子机制,包括血吸虫寄生的遗传进化机制、致病的分子基础以及免疫逃避的分子和遗传学机制;(2)肝癌发生、发展的分子遗传学机制研究:尤其对乙型肝炎病毒感染相关的肝癌表观遗传调控的分子模式、基因转录紊乱特征及与基因组不平衡性关系、肝癌发生、发展和转移的重要遗传学事件等进行深入研究,发现一批肝癌相关分子标志物,为应用奠定了理论和技术基础;(3)对神经-内分泌系统(下丘脑-垂体-肾上腺轴)、造血等正常发育、生理调控等相关基因进行研究,为理解人类正常生理,尤其内分泌系统对维持机体内稳态和对外界环境变化反应如基因表达特征和调控方式奠定基础。相关研究科研成果发表在Nature, Nature Genetics, JCI, PNAS, Hepatology, PLoS Pathogens等著名杂志,获得国际学术界好评,先后受权威综述杂志如Trends、Annual Review等邀请撰写综述发表。


生物信息学部

        为中心各科研部门的工作提供生物信息学技术支持;从事生物信息学相关软件和数据库的开发和维护,例如GLAD、GAPMap、TB Database等;以病原和宿主基因组水平的相互作用为重点,开展基因组生物信息学研究。


免疫与细胞生物学研究部

        本课题组研究方向为免疫和分子诊疗新技术,重点围绕新型重链抗体库的构建和疾病相关重要靶点分子的抗体筛选开展疾病相关的免疫诊断和治疗的基础和转化型研究;同时开展和病原菌分子诊断相关的检测方法学建立,包括对和疾病相关的常见病毒、细胞和真菌等建立基于定量PCR和二代测序的新型检测方法的建立。


伦理、法律与社会问题研究部(伦理委员会)

       成立于1998年5月,由上海地区从事哲学、伦理、法律、生物和医学研究的专家教授组成,并由国内外相关领域著名专家组成顾问委员会。主要从事人类基因组、人类干细胞、克隆技术、辅助生殖和遗传服务等生命医学科学研究和应用中的伦理、法律和社会问题研究,开展对涉及人的生物医学研究的伦理审批、遗传服务的伦理咨询和科研成果的伦理评审,并提供IRB审定书;积极开展国内外学术交流,参与和组织有关生命伦理学的学术会议;通过教育培训和科普宣传,增进公众对人类基因组及相关领域研究的了解和支持。


1.  Genetic relationship of populations in China. PNAS 1998;95:11763-11768

2.  Genomic sequence, structural organization, molecular evolution, and aberrant rearrangement of promyelocytic leukemia zinc finger gene. PNAS 1999;11422-11427  

 3.  Molecular Cloning of Six Novel Kruppel-like Zinc Finger Genes from Hematopoietic Cells and Identification of a Novel Transregulatory Domain KRNB. TheJournal of Biological Chemistry 1999;274:35741-35748

4.  Y-Chromosome Evidence for a   ......